Фамилия Колдоба звучит непривычно для русского уха, но она имеет прямое отношение к славянскому миру прозвищ и профессий. В её основе лежит древнее слово «колдоба», которое в некоторых говорах означало «колдун», «знахарь» или «ворожея». Однако есть и вторая, куда более прозаичная версия: в южнорусских и украинских диалектах «колдоба» — это вид кушанья, род мясного или рыбного пирога, а также студень, холодец. Таким образом, прозвище могли дать либо человеку, промышлявшему колдовством, либо тому, кто славился как искусный повар или любитель сытно поесть. Первая версия, основанная на значении «колдун», выглядит правдоподобнее: в старину такие прозвища давали не столько за реальную магию, сколько за необычное поведение, замкнутость или знание народных средств.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для юга России и Украины. Она образована без суффикса, путём перехода прозвища в фамилию в чистом виде (так называемые «нулевые» фамилии). В русской традиции такие фамилии чаще встречаются среди казачества и крестьянства: Колдоба, Шульга, Носач. Если бы фамилия оформлялась по северорусскому образцу, она звучала бы как Колдобин (с суффиксом -ин) или Колдобов (с -ов). Отсутствие суффикса указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где не было жёсткого помещичьего учёта, — например, среди вольных казаков или однодворцев.

Географически фамилия тяготеет к южным областям России и востоку Украины. Наибольшая концентрация носителей исторически фиксируется в бывших землях Войска Донского, в Курской и Воронежской губерниях. Там же встречаются однокоренные фамилии — Колдунов, Колдобин, Колдобаев, но Колдоба сохраняется в наиболее архаичной, бесприставной форме. Интересно, что в некоторых переписях XIX века фамилию могли записывать как «Калдоба» — через «а» в первом слоге, что отражает акающее произношение южнорусских говоров.

О социальном статусе предков-носителей фамилии можно судить косвенно. Прозвище Колдоба не относилось к престижным или знатным — в дворянской среде такие фамилии почти не встречаются. Скорее всего, предки были крестьянами, казаками или мещанами. В казачьей среде прозвища, связанные с колдовством, не были редкостью: казаки часто давали друг другу меткие клички за характер или занятие. Так что за фамилией Колдоба стоит либо человек со скрытным нравом, либо знахарь, лечивший травами, либо просто тот, кого в шутку называли колдуном за его хитрость или угрюмость.