Фамилия Колдобанов — редкий случай, когда основа прозвища почти наверняка связана с едой, но не с той, что мы привыкли видеть на столе сегодня. В русских говорах, особенно южных и украинских, «колдоба» (или «ковдоба») — это название блюда: род колбасы или кровяной колбасы, начинённой гречкой, салом или мясом. Человек, получивший такое прозвище, мог быть мясником, колбасником или просто большим любителем этого сытного кушанья. Суффикс -ан- в основе (Колдобан) характерен для прозвищ, образованных от названий предметов или действий: он придаёт слову оттенок «тот, кто имеет отношение» или «тот, кто делает». Так, Колдобан — это либо «делатель колдоб», либо человек, которого за привычку или внешность прозвали «колдобой» (например, за плотное телосложение, как у набитой колбасы).

Фамилия оформлена по стандартной патронимической модели: к основе Колдобан добавили суффикс -ов, означающий «сын Колдобана» или «принадлежащий ему». Встречаются однокоренные фамилии Колдоба, Колдобин, но Колдобанов — самая распространённая форма, и она указывает на то, что прозвище закрепилось за главой рода. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским регионам, где слово «колдоба» было в ходу. В документах XVI–XVII веков, например в актах Воронежского края, упоминаются люди с прозвищем Колдоба, что подтверждает древность этой основы.

Стоит упомянуть и альтернативную, менее вероятную версию. В некоторых говорах «колдоба» могло означать «толстая, неуклюжая женщина» или даже «ведьма» (от «колдовать»). Но связь с кулинарным термином выглядит убедительнее: прозвища по ремеслу или любимому блюду — типичный случай для русских фамилий, а вот прямое производное от глагола «колдовать» дало бы скорее формы Колдунов или Колдов. Так что предки Колдобановых, скорее всего, были людьми практичными и сытыми — мясниками, скотобоями или просто теми, кто умел хорошо приготовить колбасу.