Фамилия Колиба — редкий случай, когда корень слова не бросается в глаза, а суффикс подсказывает географию. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, здесь мы видим окончание -а, которое указывает на прозвищное происхождение. Скорее всего, перед нами не патроним (не «чей-то сын»), а прямое прозвище человека, которое закрепилось за ним и его потомками.

Самая вероятная версия связывает основу с украинским или польским диалектным словом «коліба» — так называли шалаш, временное жильё, землянку или охотничий домик в Карпатах. В гуцульском говоре «колиба» — это пастушеский балаган, крытый корой. Человек, получивший такое прозвище, мог жить в глуши, быть лесником, пастухом или просто иметь неказистое, похожее на шалаш жильё. Прозвища по типу жилья (Хата, Дом, Шалаш) в восточнославянской ономастике встречаются, хоть и нечасто.

Менее распространённая, но допустимая версия — от тюркского корня «кул» (раб, слуга) с суффиксом -ба, который встречается в татарских и башкирских фамилиях. Однако для тюркских языков форма «Колиба» нетипична: она звучит как усечённый вариант от более полного имени (например, Кулибай). Кроме того, географическое распространение фамилии (она чаще фиксируется в западных областях Украины и в Польше) говорит в пользу первой, славянской версии.

Суффикс -а в фамилиях такого типа (сравните: Нечепа, Непийпиво, Забейворота) характерен для украинской модели образования фамилий из прозвищ. В русской традиции такое окончание чаще получали фамилии, пришедшие из украинского или белорусского языков. Поэтому носитель фамилии Колиба с высокой вероятностью имеет предков с Западной Украины или из пограничных с Карпатами районов Польши.

Встречается также вариант написания «Колыба» — через «ы», что усиливает связь с украинским произношением. В любом случае, фамилия недвусмысленно отсылает к простому быту: предок был человеком, связанным с лесом, пастушеством или жившим в отдалённом, скромном месте, которое в шутку или всерьёз называли «колибой».