Фамилия Колуханов, скорее всего, является фонетической версией фамилии Колыханов, которая образована от прозвища Колыхан. Оно восходит к глаголу «колыхать», то есть «качать, волновать». Возможно, так называли человека, неуверенного в себе, либо того, кто слабо держался на ногах . Однако более вероятно, что это прозвище относилось к так называемым «профессиональным» наименованиям и указывало на род занятий человека: Колыханом могли называть и няньку, и человека, который занимался вейкой хлеба, то есть очищением зерна от плевел. Так и прозвище Колыхан закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Колуханов. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Колыхан, со временем получил фамилию Колуханов.