Фамилия Колыбель — одна из тех редких русских фамилий, что образовались напрямую от имени нарицательного, минуя суффиксы принадлежности. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин, она застыла в своей исходной форме. Это сразу указывает на её возможное происхождение: либо перед нами прозвище, данное человеку, либо, что случается реже, фамилия, закрепившаяся за представителями духовенства.

Самый очевидный и прямой путь — прозвище. В древнерусском языке «колыбель» означала то же, что и сейчас: детскую кроватку, люльку. Прозвище Колыбель мог получить человек, занимавшийся изготовлением колыбелей — столяр или плотник, специализировавшийся на этой работе. Однако не стоит исключать и переносный смысл. В говорах «колыбелью» могли назвать младшего, позднего ребёнка в семье, «баловня» или «неженку», которого долго качали. Возможно, прозвище закрепилось за тем, кто был слабым, болезненным или, наоборот, слишком изнеженным.

Вторая, менее распространённая, но вполне реальная версия — семинарское происхождение. В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков ученикам часто давали фамилии по церковным праздникам, названиям икон или просто по красивым, благозвучным словам. Колыбель могла стать такой «искусственной» фамилией, связанной с образом младенца Христа в яслях-колыбели. В этом случае фамилия не отражала бы ни ремесла, ни характера предка, а была дана из книжного или церковного обихода.

Обратите внимание на однотипные фамилии: Колыбельников, Колыбельский, Колыбелкин. Они образованы по более привычным моделям и указывают на того же мастера-колыбельщика. Сама же фамилия Колыбель стоит особняком. Поскольку она несклоняема по падежам (как и фамилии типа Соловей, Журавль), в письменных источниках её могли путать с украинскими или белорусскими формами, где такие модели встречаются чаще. Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, а также на Украине, где прозвища в форме существительного без суффикса были особенно распространены.