Фамилия Колышев образована от прозвища Колыш. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «колышка» (или «колыга»), которое в вологодских говорах имело значение «воз сена», а также «кучка навоза», в тверских – «двуколка», в рязанских – «колыбель, детская кроватка», а в ярославских – «лубяное лукошко». Вероятно, прозвище Колыш относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть сенокосцем, земледельцем, извозчиком, мастером по изготовлению детской мебели либо же заниматься плетением корзин. Согласно другой гипотезе, прозвище Колыш этимологически связано с глаголом «колыхать» - «колебать, качать, волновать». В таком случае это прозвище, скорее всего, отражало особенности характера и поведения предка (эмоциональность, зажигательность, способность влиять на настроение людей). Так и прозвище Колыш закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Колышев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Колыш, со временем получил фамилию Колышев.