Фамилия Команишина — это в первую очередь «материнская» форма, образованная с помощью суффикса -ин. В русской традиции фамилии на -ин обычно происходят от имени или прозвища отца: сын Ивана — Иванов, сын Команиши — Команишин. А вот Команишина — это фамилия, которую первоначально получали дети от матери: либо внебрачные, либо в семьях, где женщина играла главную роль, либо просто по имени матери после её смерти. В основе лежит женское прозвище или разговорная форма имени Команиша.

Самая вероятная основа — слово «комань» или «команя». В северных и сибирских говорах «команя» означало «лакомка», «сладкоежка», а также «тот, кто любит поесть». В других диалектах «коман» — это «крупный кусок» или «ломоть». То есть Команиша — это женщина, которую прозвали за любовь к еде или за то, что она «команная» (полная, дородная). Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «коман» (кочевник, половец) — но в женском варианте это звучало бы натянуто.

Географически фамилия редкая и встречается в основном в центральной России и Поволжье. В дореволюционных метрических книгах Команишины числились среди крестьян и мещан. Ударение, судя по говорам, падает на второй слог: Команúшина.

Если смотреть на словообразовательную модель, фамилия стоит в ряду таких же «материнских» образований: Марьишин, Дарьин, Наташин. Но Команишина уникальна тем, что исходное женское имя Команиша нигде не зафиксировано как каноническое — это чисто прозвищная форма, что делает фамилию особенно ценной для историков быта. Предки носительницы этой фамилии, скорее всего, были простыми людьми, и прозвище закрепилось за семьей именно через женщину.