Фамилия Комбаровы — один из тех случаев, когда прозвище предка, скорее всего, привязано не к его характеру или профессии, а к месту, откуда он был родом. В основе фамилии лежит топоним — название населённого пункта. Деревня Комбар существует и сегодня, она находится в Татарском районе Новосибирской области. Выходец из этого села получал прозвище Комбар, а его дети и внуки, по русской традиции, становились Комбаровыми.

Формант -ов в фамилии указывает на типичную модель образования: сначала было личное прозвище Комбар, а затем к нему добавили патронимический суффикс, означающий «сын» или «потомок». То есть Комбаров — буквально «сын Комбара».

Происхождение самого топонима Комбар неочевидно и вызывает споры. По одной из версий, название восходит к слову «канбар» — так называли одну из башкирских родовых групп, издавна кочевавших в Прикамье. Если эта гипотеза верна, то топоним мог возникнуть как память о проживавшем здесь башкирском роде. Другая версия опирается на татарскую лексику: «ком» означает «песок», а «бар» — «есть, имеется». В таком случае Комбар переводится как «песчаное место» или «там, где песок». Такое объяснение выглядит правдоподобным для географического названия, особенно в условиях сибирского ландшафта.

Фамилия Комбаров зафиксирована и в других регионах, что говорит о её самостоятельном, независимом возникновении в разных местах. Например, в документах XVII века встречаются служилые люди с этой фамилией на южных рубежах Русского государства. Это значит, что не все Комбаровы — потомки выходцев из одной сибирской деревни; прозвище могло возникнуть и в других локальных традициях. Тем не менее, топонимическая версия остаётся основной и наиболее обоснованной.