Фамилия Комбина — редкий случай, когда суффикс указывает на род занятий точнее, чем корень. В ней нет типичного для русских фамилий окончания -ов или -ин, зато есть суффикс -ин, который обычно образует фамилии от названий профессий или прозвищ, оканчивающихся на -а. Основа «комб-» напрямую отсылает к слову «комбайн». Однако фамилия появилась задолго до сельскохозяйственных машин XX века. Скорее всего, её давали человеку, который работал на комбинированной машине — например, на молотилке, которая совмещала несколько операций. В XIX — начале XX века так называли сложные механизмы на фабриках или в кустарном производстве. Таким образом, Комбина — это не столько прозвище, сколько профессиональная характеристика: «тот, кто управляет комбинированным устройством» или «мастер по сборке комбинаций».

Есть и другая версия, менее вероятная. В южных и западных говорах «комбина» могла означать хитроумную уловку или сложное переплетение обстоятельств. Тогда фамилия могла закрепиться за человеком изворотливого ума, но эта гипотеза слабее, потому что фамилии от отвлечённых понятий встречаются реже, чем от конкретных профессий.

Географически фамилия Комбина не привязана к одному региону, но чаще встречается на юге России и в Поволжье — в зонах активного развития машинного земледелия и перерабатывающей промышленности. В официальных документах XIX века её могли записать как Комбина или Комбинин, но форма на -а оказалась более устойчивой.

С точки зрения словообразования это типичная «фамилия-профессия» с суффиксом -ин, который в русском языке часто маркирует принадлежность к ремеслу (ср. Мельников, Кожевников, Ткачёв). Но если у тех фамилий основа ясна, то у Комбиной она требует исторического комментария: «комбайн» до эпохи тракторов — это любое устройство, соединяющее несколько функций. Так что предок современного носителя фамилии был, скорее всего, не фермером, а мастеровым — механиком или изобретателем-самоучкой, работавшим на грани техники и ремесла.