Фамилия Комяга — редкий случай, когда прозвище сохранилось почти без изменений, не обрастая типовыми суффиксами -ов или -ин. Сама основа — комяга — в русских говорах означала «толстяк», «неповоротливый человек», а в некоторых диалектах — «увалень» или «нерасторопный». Слово родственно «ком» — комок, нечто круглое и грузное. Прямое прозвище, данное по внешности или характеру, закрепилось как фамилия в форме чистой основы — такое встречается в северных и сибирских регионах, где фамилии нередко фиксировали в документах именно так, без переделки на -ов.

Вторая, менее очевидная версия выводит Комягу из профессионального прозвища. В некоторых областях «комягой» называли бондаря — мастера по изготовлению кадок и бочек. Слово могло быть искажением «комяга» от «комель» (утолщённая часть дерева) или от «ком» в значении «обрубок». Если предок был бондарем, прозвище могло перейти в фамилию по тому же принципу — без суффикса, как прямое указание на ремесло.

Ономастический словарь Б. Унбегауна не выделяет Комягу в отдельную статью, но модель образования — прозвище без оформления патронимическим суффиксом — характерна для украинских и белорусских фамилий, а также для русского Севера. География фамилии сегодня широкая, но чаще встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, что подтверждает севернорусский след. В XIX веке носители фамилии были преимущественно государственными крестьянами, реже — мещанами.

Сравните с однокоренными: Комов, Комяков — там уже суффиксы указывают на отчество или принадлежность. Комяга же осталась «необработанной», и это делает её ценной для историка языка: она сохранила живое диалектное слово в том виде, в каком его слышали в деревне.