Фамилия Конакорова — женская форма мужской фамилии Конакоров, которая образована от очень редкого и неочевидного корня. Скорее всего, в её основе лежит тюркское слово «конак» — так в ряде тюркских языков (татарском, башкирском, казахском) называют гостя, путника или постояльца. В этом случае Конакоров — буквально «сын гостя» или «принадлежащий гостю». Прозвище Конак могли дать человеку, который часто принимал путников, держал постоялый двор, или, наоборот, пришлому, чужаку, поселившемуся в новой деревне.

Суффикс -ов указывает на русскую модель патронимической фамилии, характерную для XVI–XIX веков: так закрепили прозвище отца за его потомками. А вот суффиксальная часть -ор- в основе — редкость. Возможно, это адаптация тюркского окончания «-кыр» или «-гор», что добавляет к корню значение деятеля: «конакчы» — тот, кто принимает гостей. При переходе в русскую речь «конакчы» могло превратиться в «Конакор», а затем в фамилию.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с кавказским топонимом. В Абхазии и Краснодарском крае встречается село Конаково (старое название — Конак), но фамилия Конакоров почти не фиксируется в тех регионах. География фамилии узкая: Конакоровы встречаются среди татар и башкир, а также в смешанных русско-тюркских областях Поволжья и Урала.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает редкость формы. Есть фамилии Конаков (от того же «конак») и Конакбаев (с башкирским «бай» — богатый, хозяин). Конакоров стоит особняком: двойной суффикс -ор-ов делает её похожей на профессиональные прозвища вроде «Кузнецов» или «Пекарев», но с тюркской основой. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта модель не описана — видимо, фамилия осталась локальной и не попала в общероссийские справочники.