Фамилия Конаков образована от прозвища Конак. Возможно, в его основу легло турецкое слово konak, которое переводится на русский язык как «дом сановника, вельможи», «резиденция местных властей». У сербов и других южных славян нарицательное «конак» употреблялось в значении «дворец князя». Возможно, что Конаком называли жителя, хозяина такого дома. Вполне возможно, что основатель рода Конаковых был зодчим и занимался проектированием и строительством особняков. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет значение слова «конак» как «друг, приятель, товарищ, с кем водишь хлеб-соль». Согласно другой менее правдоподобной гипотезе, фамилия Конаков восходит к крестильному мужскому имени Конон, широко распространенному в старину. Оно имеет греческое происхождение и переводится как «трудящийся, трудолюбивый». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Конак, со временем получил фамилию Конаков.