Фамилия Кондиайн — редкая, и её происхождение неочевидно для носителя русского языка. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский. Всё указывает на то, что перед нами не исконно русская, а заимствованная фамилия, которая подверглась русификации.

Скорее всего, основа фамилии — французская. Восходит она к географическому названию Кондиайн (Condé-en-Brie или, точнее, Condé-sur-l’Escaut) через фамилию Конде (Condé) с добавлением суффикса, который в русской передаче закрепился как -айн. В дворянской среде XVIII–XIX веков было модно русифицировать французские фамилии, добавляя к ним окончания, похожие на русские притяжательные прилагательные. Так Конде могло превратиться в Кондиайн (по аналогии с тем, как Бурбон становился Бурбониным, а Монморанси — Монморансиным). Суффикс -айн встречается и в ряде южнорусских фамилий, но здесь он, вероятно, результат адаптации чужого корня.

Вторая, менее вероятная версия — искусственное происхождение фамилии в среде духовенства. В семинариях будущим священникам нередко давали благозвучные фамилии, образованные от латинских или греческих слов. Можно предположить связь с латинским condio (приправлять, сохранять) или conditio (условие, основание), но это чисто умозрительная гипотеза, не подкреплённая реальными примерами по этой фамилии.

Исторически фамилия Кондиайн встречается в среде русского дворянства и интеллигенции. Наиболее известный носитель — Николай Павлович Кондиайн (1848–1903), русский горный инженер, геолог и предприниматель, занимавшийся разведкой полезных ископаемых на Урале и в Сибири. Его деятельность даёт косвенную подсказку: фамилия могла принадлежать обрусевшим выходцам из французских или швейцарских семей, которые служили в России по инженерной или горной части.

Таким образом, если ваши предки носили фамилию Кондиайн, велика вероятность, что они принадлежали к образованному сословию — дворянам или разночинцам, а корни фамилии уходят во французскую аристократическую ономастику, адаптированную под русскую модель словообразования.