Фамилия Кондоичин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не ремесло и не прозвище по внешности, а тюркское социальное положение. Корень «кондой» или «кондуй» — это титул, который в Сибири, у бурят и монгольских народов, означал «князь», «вождь» или «старейшина». Слово восходит к монгольскому «хунтай» или бурятскому «хондо» — предводитель рода. Таким образом, Кондоичин — это «сын князя» или «потомок вождя».

Суффикс «-ин» в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Кондоичин. Но здесь он прирос не к русскому, а к тюркскому корню. Фамилия могла возникнуть в среде бурятского казачества или в Забайкалье, где русские писцы фиксировали местных родовитых людей по отцу: «Иван Кондоич» — то есть Иван, сын Кондоя. Позже форма закрепилась как фамилия.

Версия о происхождении от имени Кондратий (через просторечное Кондрат и уменьшительное Кондоша) маловероятна. Для такого перехода нужен был бы суффикс «-ин» к основе «Кондош» (Кондошин), а не «Кондоич». Сочетание «-оич» в середине фамилии — явный признак тюркского, а не славянского корня.

Географически фамилия тяготеет к Восточной Сибири, особенно к Иркутской области, Бурятии и Забайкальскому краю. В европейской части России она почти не встречается. Носители фамилии — потомки тех, кто в XVII–XIX веках носил титул кондоя, но потерял его при советской власти, когда родовые звания упразднили. Фамилия сохранила память о социальном статусе предков, который в Сибири ценился выше богатства.

Других версий, например, от названия реки или поселения, нет — ни один топоним «Кондой» или «Кондоича» не зафиксирован. Разбор фамилии показывает, что перед нами не случайная запись, а точный след сибирской родословной.