Фамилия Кондрина образована от имени Кондря — краткой, обиходной формы крестильного имени Кондратий. Само имя Кондратий восходит к латинскому «quadratus», что означает «четырехугольный» или «широкоплечий». В русской традиции такие сокращённые имена (Кондря, Кондра) были распространены в простонародной среде, поэтому основатель рода Кондриных, скорее всего, принадлежал к крестьянскому или посадскому сословию.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Кондрина — «дочь» или «жена Кондри», а в более широком смысле — потомок человека по имени Кондря. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые типичны для центральных областей России, фамилии на -ин чаще встречаются на севере и северо-востоке страны. Это даёт косвенную подсказку: предки Кондриных могли жить, например, в Архангельской, Вологодской или Вятской губерниях.

Интересно, что имя Кондратий в народе часто переосмыслялось: его связывали с глаголом «кондратить» (ломать, корёжить) или с устойчивым выражением «кондратий хватил» (об апоплексическом ударе). Однако это скорее народная этимология, не имеющая прямого отношения к значению латинского оригинала. Фамилия Кондрина хранит в себе именно первоначальный смысл — указание на статность или геометрическую правильность фигуры предка, а не на бытовые страхи.

В документах фамилия фиксируется с XVII века, преимущественно в переписных книгах северных уездов. Сейчас она встречается нечасто, но сохраняет чёткую географическую привязку к русскому Северу и Поволжью.