Фамилия Кондрушин — из тех, что образованы от производной формы имени. Основа здесь — Кондруша, народный вариант канонического имени Кондратий. Такие сокращённые имена в быту были удобнее и естественнее полных, поэтому от них и пошли многие русские фамилии.

Словообразовательная модель проста и типична для центра России: суффикс -ин указывает на принадлежность. Кондрушин буквально значит «сын Кондруши» или «человек из семьи Кондруши». Это патронимическая фамилия, каких большинство в русском ономастиконе.

Само имя Кондратий имеет латинские корни — от Contradus или Quirinus, что связано с римским родовым именем. Но в русской народной среде его переосмыслили по-своему: Кондраша, Кондруша звучали просто и по-свойски. От них пошли не только Кондрушины, но и Кондрашовы, Кондратьевы, Кондруховы.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям. Встречается в Рязанской, Тамбовской, Воронежской губерниях — там, где имя Кондратий было особенно распространено среди крестьян и мещан. В XIX веке Кондрушины нередко записаны в однодворческих и государственных крестьянских списках.

В написании фамилии возможна вариативность: встречается как Кондрушин, так и Кондрушын — в старых документах буква «ы» на месте «и» не редкость из-за местного аканья и особенностей письма. Но современная орфография закрепила вариант через «и».

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов, суффикс -ин в Кондрушине указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или шипящий. Это косвенно подтверждает, что прозвищная форма Кондруша бытовала именно в мягком варианте, а не в твёрдом Кондраш.

Если коротко: Кондрушин — фамилия от имени, без сложных загадок. Её носители — потомки человека, которого в деревне звали Кондрушей, то есть ласково Кондратием.