Фамилия Кондрушины (в документах чаще встречается в форме единственного числа — Кондрушин) образована от имени Кондруша. Это народная, разговорная форма крестильного имени Кондратий. Корень здесь тот же, что и в полном церковном имени, а суффикс -уш- характерен для ласкательных и обиходных вариантов (сравните: Иван — Ванюша, Степан — Стёпуша).

Модель образования фамилии — классическая для русского севера и центральных областей: к основе на -а (Кондруш-) прибавили притяжательный суффикс -ин. Фамилии на -ин в русском языке означали принадлежность: «чей сын?» — Кондрушин, то есть сын Кондруши. Такой способ словообразования был самым массовым в XV–XVII веках, когда фамилии только закреплялись.

Имя Кондратий пришло на Русь из греческого языка и связано с латинским корнем «quadratus» — «квадратный», «широкоплечий». В народном сознании оно прочно ассоциировалось с крепостью и основательностью. Именно поэтому имя было очень популярно среди крестьян и посадских людей: его давали в честь святого Кондрата Апостола, память которого отмечается в марте и июле.

Географически фамилия Кондрушины тяготеет к Поволжью и Приуралью. В метрических книгах XIX века она регулярно встречается в Вятской, Казанской и Уфимской губерниях. Это не случайно: именно туда в XVII–XVIII веках переселялись крестьяне из центральной России, унося с собой привычные имена и фамильные прозвания. Встречаются и варианты написания — Кондрюшин, Кондрашев, но Кондрушин сохранил архаичный суффикс именно той формы, которая бытовала в живой речи.

Точное время возникновения фамилии назвать сложно: процесс становления родовых имен растянулся на несколько столетий. Однако можно уверенно говорить, что Кондрушины — не дворянский род, а фамилия крестьянская или мещанская. Она не попала в «Бархатную книгу» и родословные сборники знати, зато сохранилась в десятнях и ревизских сказках — документах, где переписывали податное население.