Фамилия Кондуров образована от прозвища Кондур, и её происхождение неоднозначно. Самая распространённая версия связывает прозвище с тюркским словом «кондур» — «бобр, бобровый». В этом случае прозвище могло указывать на трудолюбие (бобр — символ работящего человека) или на внешнюю особенность: так могли прозвать человека с большими передними зубами.

Другая гипотеза отсылает к тюркской знати. В позднем Хазарском каганате существовал титул «кундур-хакан» — третье по значимости лицо в государстве после кагана и каган-бека. Если прозвище восходит к этому званию, основатель рода Кондуровых мог быть человеком знатным и влиятельным, хотя со временем титул превратился в личное прозвище.

Есть и третья, менее распространённая версия — от киргизского «кондурга» («кожа да кости»). Тогда прозвище давали тонкому, худощавому человеку. Из всех гипотез тюркская основа с «бобром» выглядит наиболее правдоподобной: она встречается в ономастике чаще и естественнее объясняет появление прозвища из бытового наблюдения.

Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ов, то есть буквально означает «сын Кондура». Суффикс указывает на то, что фамилия закрепилась преимущественно в русской среде, а не в тюркоязычной. Географически фамилия Кондуров встречается в Поволжье и на Урале — регионах, где веками соседствовали русские и тюркские народы. В словарях фамилия нечастотна, что говорит о её локальном распространении.