Фамилия Кондусовы (в мужском роде — Кондусов) образована от личного прозвища Кондус. По самой распространённой версии, прозвище связано с украинским словом «кондук» — так называли краткую церковную песнь. В этом случае прозвище мог получить певчий или человек, любивший петь псалмы, — то есть основа указывает на род занятий или привычку, а не на внешность. В некоторых русских говорах слово «кондас» имело иное значение — «хитрый, злоречивый». Если прозвище пошло от этого корня, оно характеризовало обладателя как человека себе на уме, острого на язык.

Менее правдоподобна тюркская версия, возводящая прозвище к слову «кондыз» (бобр, бобёр). Сторонники этой гипотезы считают, что Кондусом могли прозвать охотника на бобров или отличного пловца, но для такой этимологии нет устойчивой фонетической поддержки: переход «кондыз» в «кондус» не типичен для русских заимствований из тюркских языков, поэтому эта версия уступает славянской.

Сама фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Кондус добавили патронимический суффикс -ов, означающий принадлежность. То есть Кондусов — буквально «сын Кондуса», «из рода Кондуса». Форма Кондусовы (множественное число) указывает на целый род или семью.

Точное место и время возникновения фамилии установить сложно — процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий. Но словообразовательная модель и корень позволяют отнести Кондусовых к числу старых славянских фамилий, закрепивших за потомками прозвище их предка.