Фамилия Кондуков — одна из тех, где первая мысль ведёт к тюркскому корню, и это, скорее всего, верный путь. В её основе лежит слово «кондук», которое в тюркских языках означает «свинья» или «кабан». Прозвище Кондук могли дать человеку за внешнее сходство с этим животным: грузность, упрямство, неопрятность, а иногда — за силу и свирепость в бою. Такие прозвища на Руси не считались оскорбительными, а были бытовыми и меткими. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: «чей?» — Кондуков, то есть сын или потомок человека по прозвищу Кондук.

Есть и другой, менее очевидный вариант. В некоторых русских говорах «кондук» — это диалектное название конопляного жмыха или отходов после выжимки масла. Если это так, то прозвище могло относиться к крестьянину, который занимался производством конопляного масла, либо к человеку, которого в насмешку называли «кондуком» за худобу или невзрачный вид (жмых шёл на корм скоту). Однако эта версия менее распространена, и большинство исследователей склоняются к тюркской основе.

Фамилия редкая, её географическое распространение невелико. Чаще всего Кондуковы встречаются в Поволжье и на Южном Урале — в регионах, где веками шло активное смешение русского и тюркского населения. Это косвенно подтверждает версию о тюркском корне. Встречаются также варианты написания Кондюков, где буква «ю» могла появиться под влиянием местного произношения или случайной ошибки писаря.

С социальной точки зрения, Кондуковы — почти наверняка потомки крестьян или однодворцев. Фамилия не дворянская, в родословные книги не входила. Если искать её следы в документах, то стоит смотреть ревизские сказки и метрические книги Симбирской, Самарской, Оренбургской губерний. В дореволюционных списках фамилия фигурирует редко, что говорит о её локальном характере.