Фамилия Кондюковы — одна из тех русских фамилий, где за привычным окончанием скрывается сразу несколько возможных историй. Основная версия связывает её с прозвищем Кондюк, которое восходит к диалектному слову «кондюх». В тульских говорах так называли индюка. Следовательно, первый Кондюк мог заниматься разведением домашней птицы — держать индюков, торговать ими на ярмарке. Но прозвище могло быть и чисто бытовым, без связи с ремеслом: «надулся, как индюк» говорили о человеке гордом, заносчивом или обидчивом. Так что прозвище могло характеризовать скорее характер, чем занятие.

Менее вероятная, но тоже возможная версия выводит фамилию из имени Кондратий. Полное имя Кондратий (от латинского «quadratus» — четырёхугольный, широкоплечий) в народе давало множество сокращённых форм, в том числе Кондра и Кондюх. Если принять эту гипотезу, прозвище Кондюк — не птица, а уменьшительное от крестильного имени. Однако эта версия слабее: фамилий от Кондратия гораздо больше (Кондратов, Кондратьев, Кондрашов), а прямая связь с диалектным названием индюка выглядит убедительнее.

Словообразовательная модель проста: прозвище Кондюк + патронимический суффикс -ов, означающий «сын Кондюка» или «из семьи Кондюка». Такая модель типична для русских фамилий, сложившихся в XV–XVII веках в среде служилых людей и крестьян. Фамилия оформилась, когда прозвище перестало быть личным и закрепилось за потомками.

Точное место и время возникновения фамилии Кондюковы установить сложно — процесс формирования фамилий шёл не одно столетие. Но можно предположить, что её носители происходят из южнорусских регионов, где слово «кондюх» было в ходу. Сегодня фамилия встречается редко, что только усиливает интерес к её происхождению: за ней стоит не массовая мода на церковные имена, а живое народное прозвище, родившееся в конкретном говоре и быту.