Фамилия Коноплий — редкий случай, когда в основе лежит не растение, а прозвище, связанное с ним, но оформленное не по самой частотной модели. В русских фамилиях на -ий обычно закрепляются прилагательные (Толстой, Благой), а здесь мы видим форму, которая может быть и кратким прилагательным, и существительным мужского рода в именительном падеже. Это сразу отличает Коноплия от массовых Коноплёвых и Коноплиных.

Наиболее вероятное происхождение — от прозвища Конопля. Так могли назвать человека за сходство с этим растением: например, за высокий рост и худобу (стебель конопли высокий и тонкий), за светлые, «конопляные» волосы или за привычку носить одежду из грубого конопляного холста. В говорах коноплёй иногда называли и бойкого, назойливого человека — по аналогии с тем, как растение «лезет» и быстро разрастается. Прозвище закрепилось в форме Коноплий, что могло быть вариантом украинского или южнорусского произношения: в украинском языке фамилии на -ий встречаются чаще (Шевченко — Шевченкий, но и просто Коноплий как имя прилагательное).

Вторая версия, менее вероятная, — происхождение от церковного имени Коноплий. Такое имя действительно встречается в святцах: это греческое Konoplios, означающее «комар» или «мошка». Однако имя это было редким, а связь с растением для славянского уха намного прозрачнее, поэтому большинство носителей фамилии получили её именно от прозвища.

Географически фамилия Коноплий тяготеет к югу России и Украине. В центральных и северных областях преобладают формы на -ов и -ин, а окончание -ий выдает либо украинский след, либо влияние местных говоров, где ударение падало на последний слог: Конопли́й. Такое ударение сохраняется у многих носителей до сих пор.

Социальный контекст простой: конопля была важнейшей технической культурой в крестьянском хозяйстве. Из неё делали масло, верёвки, холст. Поэтому предки с фамилией Коноплий, скорее всего, были земледельцами, выращивавшими коноплю, или ремесленниками, работавшими с этим сырьём. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это стопроцентно крестьянская или казачья фамилия, что подтверждается её распространением в среде бывших государственных и помещичьих крестьян.

В написании встречаются варианты Коноплий и Конопли́й. В официальных документах XIX века могли записать и как Коноплей, но современная орфография закрепила форму с «и» на конце. Фамилия остаётся редкой, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: найти однофамильцев несложно, а вот восстановить точную ветвь предков — задача, требующая работы с конкретными метрическими книгами по месту жительства.