Фамилия Конушанова почти наверняка образована от мужского имени или прозвища Конушан. Это редкий случай, когда в основе лежит имя, не встречающееся в святцах и не являющееся крестильным. Скорее всего, Конушан — это диалектная, обиходная форма какого-либо другого имени.

Разбирать фамилию стоит с суффикса. Формально она женского рода (Конушанова), а мужской вариант — Конушанов. Суффикс -ов указывает на типичную модель русских фамилий: «чей?» — «Конушанов», то есть сын Конушана. Сама основа «Конушан» — нестандартная, что и даёт простор для версий. Самая логичная из них: Конушан — это народная форма тюркского имени Конуш, распространённого у народов, исповедующих ислам (например, у казахов, узбеков, татар). «Конуш» в тюркских языках может означать «ночлег», «пристанище», «стоянка» (в прямом и переносном смысле — как «приют» или «друг»). В таком случае фамилия могла появиться в среде, где русские суффиксы (например, при оформлении фамилий крещёным татарам или башкирам) накладывались на местное имя. Мужской вариант «Конуш» дал бы фамилию Конушов, но если имя бытовало в уменьшительно-ласкательной форме «Конушан» (с тюркским аффиксом -ан, придающим значение ласкательности), то получается именно Конушанов.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: Конушан — это прозвище от глагола «конушать» (в диалектах — «кончать», «доделывать», а также в переносном смысле о человеке, который что-то завершает, «добивает»). Однако в этом случае фамилия была бы более распространена в северных и центральных говорах, где слово фиксировалось, но массовых следов фамилии там нет.

Географически фамилия Конушанова встречается редко, в основном на юге России и в Поволжье, что подтверждает первую версию о тюркском происхождении. Встречается также в Закавказье, что может указывать на смешанные браки или миграцию. В любом случае, фамилия указывает на то, что предок носителя носил необычное имя или прозвище, которое не закрепилось в официальном именослове, но осталось в семейном предании, записанном в фамилию.