Фамилия Конысов — один из тех случаев, когда простое на первый взгляд слово ставит перед исследователем вопрос: кого именно имели в виду, давая прозвище? Основа здесь — «коныс» или «коныса». В русских говорах это слово многозначно. В одних регионах «конысом» называли упрямого, несговорчивого человека, в других — того, кто постоянно суетится, ёрзает, не находит себе места (от глагола «конысаться» — возиться, копаться). Третья версия связывает прозвище с конём — возможно, так звали человека, который хорошо обращался с лошадьми, или, напротив, того, кто был похож на коня какой-то чертой внешности или поведения. Прямой связи с тюркским «коныс» (гость, постоялец) в русской среде почти нет, хотя для фамилий из южных степных областей такое влияние исключать нельзя.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Конысов — это сын Коныса. Фамилия закрепилась в XVI–XVII веках, когда прозвища переходили в разряд наследственных имён. Географически Конысовы чаще всего встречаются в центральных и южных областях России, в Поволжье и на Урале. Встречается фамилия и у казаков — там прозвище «Коныс» могло закрепиться за человеком беспокойным или, наоборот, медлительным, в зависимости от местного диалектного значения.

Стоит обратить внимание на редкий вариант ударения. В большинстве случаев фамилию произносят с ударением на первый слог (Кóнысов), но в некоторых семьях сохраняется ударение на второй (Коньíсов). Это может быть следствием местного говора или случайной фиксации в документах. Такие расхождения — живая примета устной истории фамилии, которую не вычитаешь в архивах.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Конысов стоит в одном ряду с Конышевым, Коныгиным, Кононовым, но отличается от них именно прозвищной основой. Если Конышев чаще выводят от уменьшительной формы имени Конон, то Конысов твёрже держится за прозвищный корень. Это делает фамилию более редкой и более «говорящей» — она прямо указывает на характер или занятие предка, а не на крестильное имя.