Фамилия Конюш — редкий случай, когда прозвище закрепилось в чистом виде, без типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая «неоформленная» фамилия, характерная для западных и южных регионов: украинских, белорусских и польских земель, где фамилии часто оканчивались на согласный или -о. Встречается она и у русских, но как привозная или как результат поздней записи.

Основа фамилии — слово «конюх». В древнерусском языке так называли слугу, ухаживающего за лошадьми. Прозвище Конюш (или Конюх) давали человеку по профессии: конюх был фигурой заметной — он отвечал за самое ценное имущество в хозяйстве, будь то боевой конь дружинника или рабочая лошадь крестьянина. Нередко прозвище закреплялось за тем, кто хорошо разбирался в лошадях, умел их лечить или объезжать.

Интересна и другая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «конюш» могло быть не профессией, а формой личного имени. В старину существовало неканоническое имя Конюх — его давали «для охраны» от сглаза или как пожелание силы (конь — символ силы и выносливости). Со временем отчество от такого имени застыло в фамилии. Но первая версия — прозвищная, по роду занятий — всё же правдоподобнее, потому что конюшня была в каждом дворе, и прозвище было на слуху.

Сравните с однокоренными фамилиями: Конюхов, Конюховский, Конюшко. Все они образованы от того же корня, но разными способами. «Конюш» — самая короткая и архаичная форма, сохранившая исходное прозвище почти без изменений. В польском языке есть фамилия Koniusz, что указывает на возможное шляхетское происхождение: «koniuszy» — придворный чин, конюший. Но для русской и украинской среды проще и точнее связывать её именно с работой при лошадях.

Географически фамилия чаще встречается на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в южной Беларуси. В России — рассеянно, без ярко выраженного ареала. Сословного барьера не было: конюхом мог быть и крепостной, и вольный казак. Точных данных о дворянских родах Конюш нет — это фамилия простого, рабочего человека, чей труд был в старину незаменим.