Фамилия Конюшэнко — яркий пример того, как украинская модель образования фамилий закрепила за родом занятий человека. Это типичная «профессиональная» фамилия, построенная по продуктивной для юго-западных земель Российской империи модели.

В её основе лежит слово «конюх» — человек, ухаживающий за лошадьми, работник на конюшне. В Малороссии и на юге России это слово звучало как «конюх», от него и пошло прозвище Конюх. Суффикс -энк(о) — один из самых распространённых в украинской ономастике. Он имеет уменьшительно-ласкательное или «сыновье» значение, то есть Конюшэнко — это буквально «маленький конюх» или, что вероятнее, «сын конюха». Ударение в таких фамилиях обычно падает на предпоследний слог: Конюшэ́нко.

Интересно, что в русском языке параллельно существовала фамилия Конюхов, образованная через суффикс принадлежности -ов. Конюшэнко же — чисто украинский вариант, который указывает на происхождение рода из среды казачества или крестьянства Левобережной Украины, Слобожанщины или южных губерний. В метрических книгах XIX века такая фамилия чаще всего встречалась у мещан и государственных крестьян Полтавской, Черниговской и Харьковской губерний.

Редкое написание через «э» (а не через «е» — Конюшенко) может быть результатом поздней канцелярской фиксации или особенностью местного говора, где «е» после шипящих произносилось ближе к «э». Однако в большинстве современных документов фамилия пишется через «е», и это не меняет её смысла: предок носителя фамилии был человеком, чья жизнь была связана с лошадьми и конюшней.