Фамилия Коргин — редкий пример, когда тюркский корень лёг в основу русской фамилии через прозвище, а не через имя. В её основе прозвище Корга, которое возводят к киргизскому слову «корго» — «охранять, защищать». Если эта версия верна, Коргой в русской среде могли называть сторожа, а также отца большого семейства или единственного сына, которого берегли как зеницу ока. Прозвище давали не по внешности, а по социальной роли: тот, кого нужно оберегать, или тот, кто сам оберегает.

Модель образования проста: к основе Корг- добавили патронимический суффикс -ин, характерный для русских фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я. Так из прозвища Корга возникла фамилия Коргин — «сын Корги».

Существует и альтернативное объяснение: фамилия могла возникнуть из прозвища Карга, но это предположение менее убедительно, поскольку требует дополнительного фонетического перехода «а» в «о», который не подтверждается устойчивой традицией. В любом случае, перед нами фамилия, которая сформировалась не от крестильного имени, а от бытового прозвища, что типично для поздних русских фамилий, особенно в среде крестьян и служилых людей. География фамилии не широка, что указывает на локальное происхождение — вероятно, в регионах с тюркским влиянием, где слово «корго» могло быть понятно и употребимо в быту.