Фамилия Коргунюк — украинская по происхождению, что выдают суффикс -юк и характерная для западных регионов манера оформления фамилий. Суффикс -юк в украинской ономастике означает «маленький» или «сын»: Коргунюк — буквально «сын (или потомок) Коргуна». Вопрос упирается в то, что такое «Коргун».

Скорее всего, в основе лежит прозвище Коргун. Его можно связать с диалектным глаголом «коргать» — в некоторых говорах (особенно юго-западных) это значит «корчить», «сводить судорогой», «морщить», «делать гримасы». Коргуном могли прозвать человека с нервным тиком, того, кто часто морщится или хмурится. Либо — более прозаичная версия: «коргать» означало и «ломать», «гнуть», так что прозвище могло достаться жесткому, упрямому человеку или, наоборот, горбуну (от «скорченный»). Вторая версия, менее вероятная, — что «Коргун» — это искаженная форма имени Горгун, производного от Гордей или Георгий: в украинских говорах звук «г» на стыке мог перейти в «к» под влиянием соседних согласных, но это уже домысел без твердых параллелей.

Географически фамилия Коргунюк привязана в основном к западной Украине — Волынь, Ровенщина, Хмельнитчина. Там суффикс -юк встречается массово, и носители фамилии до сих пор сконцентрированы в этих областях. Встречается и вариант Коргонюк — с буквой «о» во втором слоге, что может быть следствием аканья или просто описки в документах. Сословно предки Коргунюков, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии на -юк редко носили шляхта, это «народный» тип образования.

Родственных фамилий в украинской среде много: Коргун, Коргуненко, Коргуненок. В русском контексте аналогов почти нет — это чисто западноукраинский патроним, который не перекочевал в великорусские земли в сколько-нибудь заметном количестве. Так что если фамилия Коргунюк встречается за пределами Украины, это почти наверняка следы миграций XX века.