Фамилия Корнеюк — типичный пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -юк. Этот суффикс указывает на принадлежность к роду: Корнеюк — это «сын Корнея» или «маленький Корней», а в более широком смысле — потомок человека по имени Корней.

Основа фамилии — каноническое христианское имя Корнелий. В русской и украинской традиции оно приняло форму Корней. Имя это латинского происхождения, от римского родового имени Cornelius, которое, в свою очередь, связывают со словом cornu («рог»). В народной среде имя было распространённым, но не таким частым, как Иван или Пётр, поэтому фамилия Корнеюк встречается реже однокоренных Корнеев или Корнилов.

География фамилии привязана к западноукраинским землям — Волыни, Подолью, Галичине. Суффикс -юк особенно характерен для фамилий, возникших в этих регионах в XVI–XVII веках, когда оформлялась украинская фамильная система. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, образованных от полной формы имени, украинский -юк передавал значение «младший член семьи» или «сын», что делало фамилию изначально более личной и патронимической.

Встречается и вариант написания с одной «н» — Корнеюк, что отражает просторечное произношение имени Корней без удвоения. Такое написание не ошибочно, а исторически сложившееся. В документах XIX века можно найти обе формы, причём вариант с одной «н» даже преобладает в метрических книгах Подольской губернии.

Прозвищной основы у фамилии нет: она образована не от внешности или ремесла, а от имени предка. Поэтому предки современных Корнеюков были, скорее всего, крестьянами или казаками, носившими имя Корней, а их потомков в официальных бумагах начали записывать по отцу — «Корнеев сын» или «Корнеюк». Известных носителей фамилии, прославившихся в науке или искусстве, в открытых источниках немного, что говорит о её бытовом, а не аристократическом происхождении.