Фамилия Корнилин ведет начало от уменьшительной формы крестильного имени Корнелий — Корнила. Само имя Корнелий восходит к латинскому слову, означающему «рог». В русской традиции имя Корнила было распространено в народной, бытовой среде, а от него уже образовалось множество фамилий: Корнилов, Корнильев, Корнилиев и, наконец, Корнилин.

Модель образования фамилии проста: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «корнилин», то есть сын Корнилы. Такая патронимическая модель (от имени отца с суффиксом -ин) типична для северных и центральных областей России, где она конкурировала с более распространённой формой на -ов/-ев. Если Корнилов — фамилия общерусская и частотная, то Корнилин встречается заметно реже и может указывать на конкретный регион бытования, например, на Вологодчину, Архангельскую или Костромскую губернии, где суффикс -ин в патронимах был особенно живуч.

Стоит отметить, что в основе лежит не полное церковное имя Корнелий, а его просторечный вариант Корнила. Это характерно для фамилий, которые складывались в крестьянской и посадской среде в XV–XVII веках: люди чаще использовали обиходные формы имён, а не официальные. Таким образом, фамилия Корнилин — не просто указание на имя предка, а свидетельство его социального круга и местной языковой традиции.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Корнилин стоит в одном ряду с Корниловым и Корнильевым, но отличается именно суффиксальным оформлением. Это не ошибка или искажение, а самостоятельная модель, которая могла закрепиться в отдельной ветви рода. Поэтому носители фамилии Корнилин, скорее всего, происходят из семей, где имя Корнила передавалось по наследству, а сама фамилия не менялась при переездах или смене сословия.