Фамилия Корнюховы образована от имени собственного Корнюх — уменьшительной формы крестильного имени Корнелий. В переводе с латыни Cornelius значит «рог», и эта основа легла в основу целого ряда фамилий: Корнеев, Корнилов, Корнюшин, Корнюхов. Если Корнеев и Корнилов образованы от полной церковной формы, то Корнюхов — от разговорного, обиходного варианта, который бытовал в крестьянской и купеческой среде. Именно такие «домашние» имена чаще всего становились фамилиями в северных и центральных губерниях России, где любили усечённые формы.

По суффиксу -ов фамилия относится к самому массовому типу русских фамилий: так образовывали притяжательные прилагательные с ответом на вопрос «чей?» — чей сын? Корнюхов. То есть буквально фамилия означала «сын Корнюха», а сам Корнюх — это, скорее всего, не прозвище, а ласкательное или повседневное имя, под которым человека знали в семье и в деревне. В документах XVII–XVIII веков можно встретить записи вроде «Ивашко Корнюх» или «Корнюх Фёдоров сын» — это и есть та стадия, когда имя ещё не закрепилось как наследственное, но уже передавалось от отца к сыну.

О точном месте и времени возникновения фамилии Корнюховы говорить сложно: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на два с лишним века. У крестьян фамилии массово закреплялись после отмены крепостного права в 1861 году, тогда же многие Корнюховы получили свою фамилию официально. Однако отдельные носители могли появиться и раньше — в среде посадских людей или однодворцев южных губерний, где фамилии фиксировались уже в XVII веке.

Стоит заметить, что в народной этимологии фамилию иногда связывают с корнем «корнюха» — так в некоторых говорах называли коренастого, крепкого человека или того, кто гнёт спину на тяжёлой работе. Но это вторичное осмысление: языковеды (в частности, Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») указывают, что основа здесь именно антропонимическая, от канонического имени. Сравните с фамилиями Корнюшин, Корнюшов — у них та же природа, просто разные суффиксы.

В итоге фамилия Корнюховы — не редкая, но и не сверхраспространённая. Она встречается в основном в центральной России и Поволжье, реже — на Урале. Если вы носите эту фамилию, то с большой вероятностью ваш предок в XVI–XVII веках носил имя Корнюх, а его сыновей уже записывали как Корнюховых. Это не дворянская фамилия, а типичная крестьянская или посадская, что не делает её менее интересной для изучения.