Фамилия Космына — яркий пример «материнской» фамилии, образованной через суффикс -ин. Такие фамилии в русской традиции давали детям, воспитанным одной матерью (чаще всего вдовой), или указывали на прямую принадлежность к женщине-главе семьи. В основе лежит женское имя Космына — производная форма от канонического имени Косма. В церковной традиции это имя греческого происхождения (от «космос» — «мир, порядок, украшение»), в народном обиходе оно дало множество форм: Кузьма, Козьма, а также женские варианты Космыня, Космына.

Ключевая особенность — фамилия сохранила архаичную основу на -ына, а не на более привычную -ина (как в фамилии Космина). В старых говорах и при переписях встречалось написание через «ы» после твёрдого согласного, что закрепилось в документах. Такое написание — верный признак того, что фамилия фиксировалась в письменных источниках ещё в XVII–XVIII веках, когда нормы русского правописания не устоялись.

По географии бытования фамилия Космына встречается преимущественно в центральных и северных областях России, особенно в бывших Новгородской и Вятской губерниях. Там имя Косма (Кузьма) было одним из самых распространённых, а отчества и фамилии от женских форм — обычным явлением. Встречается и вариант Космынин — с двойным суффиксом, что указывает на более позднее оформление.

Прозвищная версия, хотя и менее вероятна, тоже возможна: «космыня» в некоторых диалектах — растрёпанный, лохматый человек (от «космы» — волосы). Но в таком случае фамилия скорее сохранила бы форму Космынин или Космынов, а не -ин, указывающий на прямое обладание. Поэтому основная и самая правдоподобная гипотеза — через женское имя.

Носители фамилии Космына — потомки тех, кого в семье называли «Космынин сын» или «Космынина дочь», то есть ребёнок женщины по имени Космына. В сословном плане это чаще всего крестьяне и посадские люди, реже — духовенство, где имя Косма также почиталось (святой Косма Бессребреник).