Фамилия Косточкир — один из тех редких случаев, когда прозвище не затерялось в веках, а сохранилось почти в неизменном виде. Её основа — глагольная форма «косточкир» или «косточкирить», то есть заниматься мелкой, кропотливой работой, буквально «выковыривать косточки». Чаще всего так в народе называли тех, кто чистил рыбу или разделывал мясо, отделяя мясо от костей. Но было и переносное значение: так могли прозвать дотошного, придирчивого человека, который «выковыривает» из каждого дела мельчайшие детали, или, наоборот, бедняка, которому доставались объедки.

Словообразовательная модель фамилии нестандартна. Обычно русские фамилии образуются с помощью суффиксов принадлежности (-ов, -ин, -ский) от имени или профессии отца. Здесь же — чистая основа прозвища, застывшая в именительном падеже без дополнительных суффиксов. Такое оформление встречается у фамилий, которые возникли позже, в среде однодворцев или в южнорусских и украинских говорах, где прозвище часто переходило в фамилию напрямую. В словаре Б. Унбегауна подобные примеры — «Скоробогач», «Неумывака» — относятся к группе «говорящих» фамилий, образованных от прозвищ-характеристик.

Географически фамилия крайне редкая и локальная. Основные следы ведут в южные регионы России — в Ростовскую область, Краснодарский край, а также в восточную Украину. Встречаемость — единичные случаи на миллион, что говорит о том, что прозвище не стало массовым и не было связано с какой-то крупной профессиональной династией. Возможно, предок носителя был рыбаком или работал на кухне в богатом доме, где требовалась особая аккуратность при разделке.

Спорных версий здесь немного. Иногда фамилию пытаются связать с косточками плодов (вишни, сливы), но глагол «косточкирить» в значении «вынимать косточки из ягод» не зафиксирован в диалектных словарях как самостоятельное занятие, в отличие от рыбного или мясного промысла. Поэтому версия с разделкой рыбы или мяса выглядит правдоподобнее. Ещё реже встречается предположение, что это искажённое «косточкар» — тот, кто делает костяные изделия, но суффикс -ир в основе указывает именно на действие, а не на профессию.

Фамилия Косточкир — яркий пример того, как прозвище, данное за конкретное занятие или черту характера, пережило века и дошло до нас почти без изменений. Она не получила дворянского герба и не попала в родословные книги, но хранит память о простом человеке, чья работа требовала терпения и точности.