Фамилия Косякины принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от личного прозвища. В её основе лежит прозвище Косяка, а оно, в свою очередь, восходит к многозначному слову «косяк». Владимир Даль в своём словаре фиксирует целый ряд значений: «косой ломоть, пластина клином», «лоскуток», «вставка в подоле мужской рубашки по бокам», «клин земли», а также «толстое косое токарное долото». Эта многозначность открывает сразу несколько версий происхождения прозвища.

Самая вероятная версия — профессиональная. Прозвище Косяка мог получить человек, работавший с клиньями, отрезами или косыми деталями: землемер, отмерявший клинья земли, токарь, работавший особым долотом, или портной, вставлявший боковые клинья («косяки») в рубаху. Вторая версия — бытовая или внешняя: прозвище могли дать за манеру носить одежду с такими вставками или за какую-то кривизну, «косость» в фигуре или походке.

Модель образования фамилии проста и типична для центральной России: суффикс -ин присоединялся к основе на -а, указывая на принадлежность («чей?» — сын Косяки). Таким образом, Косякины — это прямые потомки человека по прозвищу Косяка.

Интересно, что фамилия Косякин — не единственная в этом гнезде. Существуют однокоренные Косяковы (с суффиксом -ов, что говорит о другой диалектной или грамматической форме прозвища — Косяк) и Косячковы (с уменьшительным суффиксом). Такое разнообразие указывает на то, что прозвище было живым и распространённым в разных говорах.

Точное место возникновения фамилии Косякины установить сложно: процесс закрепления прозвищ в качестве наследственных имён шёл несколько столетий. Однако сама модель на -ин, а также связь с конкретными ремёслами (портняжное, токарное, землемерное дело) позволяет отнести фамилию к числу древних, возникших в среде посадского или крестьянского населения не позднее XVI–XVII веков.