Фамилия Косяковая — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной. В русской традиции фамилии на -ая обычно принадлежали женщинам, но в некоторых областях, особенно на юге России и в казачьих регионах, такие формы становились родовыми и передавались по наследству. В официальных документах мужчина мог числиться Косяковым, а его жена и дети — Косяковыми, но со временем женская форма вытеснила мужскую и стала фамилией для всех членов семьи.

Основа фамилии — «косяк». Это слово многозначное, и прозвище могли дать по разным причинам. Самое очевидное — косяк как дверной или оконный переплёт. Прозвище Косяк мог получить плотник, столяр или мастер, делавший оконные рамы. Вторая версия связана с рыбой: косяк — стая рыб, идущая на нерест. Тогда прозвище могло принадлежать рыбаку, который знал пути движения косяков, или человеку, торговавшему рыбой. Третье значение — косяк лошадей: табун, где жеребец водит кобылиц. В южных степях такое прозвище давали коневоду или табунщику.

Менее очевидный, но возможный вариант — прозвище по характеру. В диалектах «косяк» иногда означало упрямого, кривого или неладного человека (от «косой»). Однако это значение встречается реже и обычно не становится основой для фамилии без дополнительных подтверждений.

Суффикс -ов- типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён. Форма Косяковая с окончанием -ая указывает на притяжательное значение: «из рода Косяка». В некоторых говорах, особенно на Дону и Кубани, фамилии на -ая (Кривая, Белая, Косяковая) бытовали как полные родовые имена, а не только женские варианты. Поэтому носитель фамилии Косяковая мог быть потомком плотника, рыбака или коневода из южнорусских или казачьих земель.

Фамилия редкая, в списках распространённых не встречается. Её география — в основном Краснодарский край, Ростовская область, Ставрополье. Точная дата возникновения не установлена, но по модели образования фамилия могла сложиться в XVII–XVIII веках, когда у казаков и крестьян активно закреплялись родовые прозвища.