Фамилия Ковенковы — один из тех случаев, когда фамилия прямо указывает на профессию предка. Её основа — прозвище Ковенко, которое образовано от глагола «ковать». Так в славянской среде, особенно на юге России, в Белоруссии и на Украине, называли кузнеца. Кузнечное дело было повсеместным и уважаемым ремеслом, поэтому фамилии с корнем «ковен/кован» встречаются часто: Ковалёв, Коваленко, Ковальчук, Ковенко и, наконец, Ковенков.

Прозвище Ковенко закрепилось за человеком как основное бытовое имя, а затем, при оформлении фамилий, к нему добавили русский суффикс -ов. Модель образования проста: от прозвища на -о (Ковенко) через патронимический суффикс получается фамилия Ковенков, буквально «сын Ковенко». Такая схема типична для фамилий, возникших в центральных и северных областях России, куда переселялись носители южных прозвищ.

Самобытность фамилии — в сочетании украинского или белорусского по происхождению прозвища с русским фамильным суффиксом. Это отражает исторические миграции: предок-кузнец мог носить прозвище Ковенко в Малороссии, а его потомки, осев в великорусских землях, получили фамилию в форме Ковенковы. Впрочем, окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований — процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда привязан к одной местности.