Фамилия Ковнеристова — женская форма фамилии Ковнеристов, и её разбор требует внимания к редкой словообразовательной модели. В русских фамилиях суффикс -ов- самый распространённый, но основа Ковнерист- нестандартна и не встречается в обиходной лексике. Скорее всего, перед нами профессиональное прозвище, образованное от названия ремесла с помощью сложного суффикса -ист-, который в русском языке обычно указывает на лицо по роду занятий (гитарист, машинист). В основе лежит слово «ковнер» — это диалектный вариант слова «ковш» или «ковшовый», а также название меры сыпучих тел в некоторых регионах. Человек, которого прозвали Ковнеристом, мог быть мастером по изготовлению ковшей, либо торговцем, отмеряющим товар ковнерами (ковшами). Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Ковнер по модели «сын Ковнера» (Ковнер + -ист + -ов), но такая конструкция для русских фамилий нетипична — обычно отцовские прозвища оформляются проще (Ковнеров). Поэтому первая версия, с прямым указанием на занятие, выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где слово «ковнер» фиксируется в значении «ковш» или «черпак». В центральных и северных областях России чаще использовали «ковш», а «ковнер» — локальная форма. Это даёт основание предполагать, что предки носителей фамилии жили в районах с развитым кустарным производством утвари или на торговых путях, где была нужна мерная посуда.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Ковнеров, Ковнир, Ковнерук) показывает, что Ковнеристов — более поздняя и редкая форма, закрепившаяся в письменных документах скорее всего в XVIII–XIX веках, когда прозвища начали массово оформлять стандартными суффиксами. В современном употреблении фамилия встречается нечасто, что делает её ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем больше шансов восстановить историю конкретного рода.