Фамилия Ковыко — редкий пример, когда прозвище сохранилось почти без изменений, не обрастая стандартными русскими суффиксами -ов или -ин. Её основа — слово «ковыка» или «ковык», которое в русских говорах означало человека с неловкой, раскачивающейся походкой. Глагол «ковылять» (идти вперевалку, прихрамывая) прямо указывает на то, что предок носителя фамилии получил прозвище за манеру ходить. Это типичная модель для прозвищ, описывающих внешние черты или поведение.

Словообразовательно фамилия построена по украинской или белорусской модели: суффикс -ко (уменьшительно-ласкательный или указывающий на принадлежность) присоединён к основе «ковык». В украинской и южнорусской традиции фамилии на -ко (Коваленко, Шевченко, Бондаренко) очень распространены, но Ковыко стоит особняком, так как в её основе не профессия, а именно прозвище. Форма «Ковыко» (с ударением, скорее всего, на последний слог) указывает на происхождение из западнорусских земель или современной Украины.

Интересно, что в некоторых говорах «ковыка» могло означать не только походку, но и упрямого, неуступчивого человека — того, кто «ковыряется» в делах, не желая уступать. В таком случае прозвище могло быть не только внешним, но и характеризовать характер. Споров о происхождении здесь почти нет: связь с «ковылять» и «ковыка» — прямая и единственная правдоподобная версия, которую подтверждают данные диалектных словарей.

В отличие от многих фамилий, которые со временем меняли окончание или переходили в другую модель, Ковыко сохранила свою первоначальную форму. Это значит, что носители фамилии, скорее всего, не были в составе дворянского сословия (где фамилии часто русифицировали), а происходили из крестьянской или казацкой среды, где прозвища передавались по наследству без изменений. Географически фамилия встречается преимущественно на западе России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает её западнославянский суффикс.