Фамилия Койра — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, перешло в фамилию почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. Это сразу указывает на географию: такие «голые» фамилии характерны для западных и южных регионов бывшей Российской империи — Украины, Белоруссии, а также для польского и литовского пограничья. Если бы фамилия оформилась в центральной России, мы бы с высокой вероятностью увидели Койрова или Койрина.

Основной корень — «койра» — в славянских языках имеет несколько значений, но все они сводятся к одному бытовому образу. В украинском и белорусском диалектах «койра» — это большая корзина, кузов или сплетённый из лозы короб. Прозвище Койра могли дать корзинщику, торговцу, который возил товар в таких коробах, или просто человеку с крупным, «мешковатым» телосложением — по ассоциации с ёмкостью.

Существует и менее очевидная версия, связанная с балтскими языками. В литовском «kairė» означает «левая сторона», «левая рука». В пограничных с Литвой районах прозвище Койра могло закрепиться за левшой. Эта гипотеза слабее, так как фамилия встречается и вдали от балтского ареала, но полностью её отбрасывать не стоит. Спор решается просто: если в вашем роду есть предания о предке-корзинщике или если фамилия распространена на Черниговщине или Волыни, версия с корзиной — основная.

Обратите внимание на суффикс: отсутствие патронимического суффикса (как в фамилиях Шевченко, Тимошенко) роднит Койру с украинской моделью прозвищных фамилий. В польской традиции такое окончание тоже встречается, но обычно в более краткой форме (например, Kojra). Таким образом, с высокой вероятностью фамилия — украинского или белорусского происхождения, а её носитель в первом поколении был либо ремесленником, либо обладателем заметной внешней черты.

В современных базах фамилия Койра встречается крайне редко, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы носите эту фамилию, скорее всего, все её носители в России и ближнем зарубежье — ваши дальние родственники или выходцы из одного небольшого региона.