Фамилия Козаковский — типичный пример фамилии на -ский, которые в Польше и на западнорусских землях (Украина, Беларусь) были маркером шляхетского или казацкого старшинского происхождения. В отличие от простых крестьянских фамилий на -ов/-ев, окончание -ский указывало на принадлежность к месту или роду, часто — к владельческому имению.

Основа фамилии — прозвище или этноним «козак» (в дореволюционном написании через «о»). В польской и украинской традициях «козак» означало не только запорожского воина, но и вольного человека, батрака, наёмного работника. Суффикс -ов- в середине — притяжательный, то есть Козаковский буквально: «выходец из владений Козака» или «сын козака». Модель образования та же, что у фамилий Павловский (от Павла), Ивановский (от Ивана) — только в роли личного имени выступает прозвище.

Географически фамилия распространена в основном на территории бывшей Речи Посполитой: в Западной Украине, Беларуси, на Подляшье. В Российской империи носители Козаковских чаще всего принадлежали к мелкопоместной шляхте или казачьей старшине, а после разделов Польши их записывали в мещанство или однодворцы. Встречается и вариант написания Казаковский — с буквой «а» в первом слоге, что отражает южнорусское или украинское произношение.

Спорный момент: не путать с однокоренной фамилией Казаков. Козаковский — не просто «сын казака», а именно топонимическая фамилия: предок получил её от названия хутора, деревни или усадьбы Козаково, Козаковка. Таких топонимов в западных губерниях было десятки, поэтому точное место происхождения конкретной ветви установить без генеалогического поиска невозможно.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» (1972) модель на -ский/-цкий описывается как преобладающая у польской шляхты и украинской старшины, а фамилии с основой «козак» он относит к группе, образованной от названий социальных групп. Таким образом, Козаковский — фамилия с двойным социальным кодом: она одновременно указывает и на сословную принадлежность (шляхта/старшина), и на род занятий или прозвище предка.