Фамилия Козенева — женская форма, мужская — Козенев. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Козень. Слово «козень» в русских говорах означало «козел», причем не только животное, но и, в переносном смысле, упрямого, бодливого или своенравного человека. Такие «животные» прозвища были распространены на Руси повсеместно: их давали не в обиду, а как примету характера или внешности.

Словообразовательная модель здесь не совсем стандартная. Суффикс -ев- (вместо более частого -ов-) указывает на то, что основа исходного прозвища оканчивалась на мягкий согласный или шипящий: Козень — Козенев. Это типично для северных и северо-восточных регионов России, где «е» в суффиксе сохранялось под ударением или в безударной позиции. В южных и западных говорах чаще встречалась бы форма Козенов или Козин.

Интересно, что существует и другая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «козень» — это не животное, а вид ремесленного инструмента или деталь упряжи. Если предок носил такое прозвище, он мог быть, например, кузнецом, изготавливавшим козни (крюки, скобы), или бондарем, работавшим с козлами-подставками. Однако эта версия уступает первой по распространенности: подавляющее большинство «звериных» фамилий восходит именно к личным прозвищам.

В документах фамилия фиксируется с XVII века. В переписных книгах Воронежского уезда 1670-х годов упоминаются служилые люди Козеневы — казаки и дети боярские. Это не значит, что все носители фамилии — потомки дворян. Скорее, Козеневы были в основном крестьянами и однодворцами (особенно в Курской, Орловской, Тамбовской губерниях), где прозвища цепко держались в быту и переходили в официальные фамилии после отмены крепостного права.

Сейчас Козенева — фамилия редкая. Ее можно встретить в центральной России и в Поволжье, но концентрация выше всего на границе Тульской и Рязанской областей. Там, в писцовых книгах XVI века, записаны деревни, где жили «козени» — люди с таким прозвищем. Так что географический след фамилии ведет именно в те края.