Фамилия Кожеко — типичный пример восточнославянской модели, где суффикс -ко указывает на «сына» или «потомка» человека с соответствующим прозвищем. В основе лежит прозвище Кожека, а оно, скорее всего, связано с ремеслом. Исходное слово — «кожа». В старину кожевенное дело было одним из самых распространённых и уважаемых: мастера выделывали шкуры, шили обувь, упряжь, сумки. Человека, занятого этим трудом, могли прозвать Кожей или Кожекой — уменьшительно-ласкательная форма, характерная для разговорной речи.

Модель образования простая: прозвище Кожека + патронимический суффикс -ко. В белорусской и украинской традиции такие фамилии на -ко (Петренко, Шевченко) означали «чей-то сын». Кожеко буквально — «сын Кожеки». Со временем прозвище закрепилось как наследственное имя, вытеснив крестильное.

География фамилии — западные и центральные регионы бывшей Российской империи. В документах начала XX века встречаются носители из Виленской губернии (деревня Сазоновщина) и Смоленской области (село Кубаровское). Например, в 1886 году родился Степан Данилович Кожеко, а в 1875-м — Татьяна Ивановна Кожеко. Эти записи подтверждают, что фамилия бытовала среди крестьян и мещан, а не в дворянских родах.

Версия о происхождении от прозвища, связанного с кожей, — основная и наиболее правдоподобная. Альтернативные гипотезы (например, от тюркского корня или личного имени) не имеют серьёзных подтверждений, поэтому их можно отбросить. Фамилия редкая, нетиражированная, что говорит о её локальном характере и, вероятно, происхождении от одного конкретного мастера-кожевника.