Фамилия Кожеков — один из тех случаев, где за кажущейся простотой кроется неочевидная основа. На первый взгляд, в ней слышится «кожа», но при ближайшем рассмотрении связь оказывается не прямой, а скорее профессиональной или прозвищной.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а основа — Кожек. Сама основа, скорее всего, восходит к прозвищу Кожек. В русских говорах и в ономастике известны подобные формы: Кожек, Кожух, Кожемяка. Прозвище Кожек могло принадлежать человеку, имевшему отношение к выделке кож — кожевнику, скорняку или торговцу кожей. Суффикс -ек здесь уменьшительно-ласкательный или, что вероятнее, указывает на конкретный предмет: «кожек» — это небольшой кусок кожи, кожаный мешок или, в некоторых диалектах, кожаная безрукавка. Таким образом, прозвище могло быть дано по характерной одежде или по роду занятий.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «кожек» или «козек» означает «маленький глаз» или «глазок». Если фамилия бытует в регионах с сильным тюркским влиянием (Поволжье, Урал, Сибирь), её основа могла быть переосмыслена русским населением. Однако для центральной России и севера более вероятно кожевенное происхождение.

Географически фамилия Кожеков встречается нечасто. По данным современных баз, она рассеяна, но заметные скопления есть в Кировской области, в Удмуртии и на юге Сибири. Это косвенно подтверждает обе версии: и кожевенный промысел, и возможное тюркское заимствование.

В отличие от более частых фамилий вроде Кожевников, Кожин или Кожухов, Кожеков сохранила редкую уменьшительную форму основы. Это говорит о том, что прозвище было дано не просто по профессии, а по какому-то конкретному, возможно, бытовому признаку: человека могли звать Кожек за то, что он носил кожаную куртку, или за то, что он был невысок ростом и «кожаный» — в значении коренастый. В любом случае, предок носителя этой фамилии был человеком, чья внешность, одежда или ремесло запомнились окружающим настолько, что стали родовым именем.