Фамилия Козякины — одна из тех, где основа на первый взгляд кажется простой, а на деле ставит исследователя в тупик. В ней работает типичная русская модель: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть предок носителя фамилии был известен как Козяка. Всё упирается в то, что значило это прозвище.

Самая прямая и очевидная версия — связь с диалектным словом «козяка». В южных и западных говорах так называли козявку, букашку или мелкое неприятное насекомое. Прозвище могли дать человеку маленького роста, суетливому или, напротив, назойливому. Вторая версия менее очевидна, но имеет право на существование: «козяка» могла быть искажённой формой от «козак» (казак), особенно в регионах, где аканье было сильным. В таком случае фамилия Козякин могла означать «сын казака», но эта гипотеза слабая, поскольку фамилии на -ак обычно не теряют конечный согласный при образовании на -ин.

Интересно, что фамилия Козякины встречается редко и имеет ярко выраженную региональную привязку. Основной ареал — юг России, особенно Курская, Белгородская и Воронежская области, а также Украина. Это совпадает с зоной бытования слова «козяка» в значении «жучок». Встречаются варианты написания Козякин и Козякина, но форма множественного числа (Козякины) чаще всего указывает на целый род, а не на одну семью.

В словарях русских фамилий эта фамилия не фигурирует как отдельная статья, но её однокоренные аналоги (Козявкин, Козюкин) подтверждают прозвищное происхождение от названий мелких существ. Сословная принадлежность Козякиных не закреплена: среди носителей встречаются и крестьяне, и мещане. Фамилия не дворянская и не купеческая, что тоже говорит в пользу прозвища, данного по внешности или характеру, а не по роду занятий.