Фамилия Козюпа звучит необычно для русского уха, но её происхождение прозрачно, если присмотреться к украинскому языку и народным промыслам. В основе лежит украинское слово «козуб» — так называли лукошко или корзину, сплетённую из лыка или прутьев. Чередование согласных б/п и гласных у/ю в корне — не случайность, а результат живых исторических процессов в языке, когда твёрдые звуки смягчались или глухие заменяли звонкие в диалектах.

Скорее всего, прозвище Козюпа получил человек, который плёл такие корзины или торговал ими. На востоке Украины и в прилегающих областях России это ремесло было распространено: «козуб» — не просто тара, а привычная утварь для сбора грибов, ягод или хранения продуктов. Прозвище закрепилось за мастером, а затем перешло к его детям и внукам без изменений.

Модель образования фамилии — без суффикса, что встречается реже, чем типичные -ов/-ев. Фамилия Козюпа — это застывшее прозвище в именительном падеже. Такая форма характерна для украинской ономастики, где личное имя или прозвище часто становилось фамилией напрямую, без дополнительных окончаний. В русском языке подобные фамилии тоже встречаются, но обычно в южных регионах, где украинское влияние было сильным.

Если искать аналоги, то Козюпа стоит в одном ряду с фамилиями Козуб, Козубенко, Козубов. Все они указывают на одно и то же занятие предка — корзиночника. Но Козюпа выделяется именно своей фонетической формой: замена уб на юп могла возникнуть в говорах, где «козюпой» называли не просто корзину, а, например, маленькое лукошко или изделие из более тонкого прута.

Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном бытовании. Носители Козюпы чаще всего имеют корни в Черниговской, Полтавской или Сумской областях Украины, а также в приграничных районах России (Брянская, Курская области). Именно там слово «козуб» было в ходу, а прозвище Козюпа могло закрепиться за конкретным родом ремесленников.

Никакой иной, более древней или иноязычной версии происхождения у фамилии нет. Это чисто славянское, бытовое прозвище, которое точно описывало занятие предка.