Фамилия Крачкова — женская форма фамилии Крачков, и её разбор стоит начать с мужского варианта, потому что именно он хранит ключ к происхождению. В основе фамилии лежит прозвище Крачок. В русских говорах, особенно южных и западных, «крачок» — это уменьшительное от «крак» (звукоподражательное) или диалектное название грача, вороны, а иногда и небольшого ястреба-перепелятника. Птицу могли прозвать за характерный крик «кра-кра» или за манеру сидеть скорчившись, сгорбившись — «крачиться» в некоторых диалектах означает горбиться, съёживаться.

Менее вероятная, но возможная версия связывает Крачка с польским или украинским словом «kraczka» — так называли маленькую лодку-долблёнку, челнок. В этом случае прозвище мог получить лодочник, перевозчик или тот, кто делал такие лодки. Однако для фамилии Крачков, распространённой в основном в русскоязычной среде, «птичья» версия выглядит убедительнее: прозвища от названий птиц давали людям по внешнему сходству, по голосу или по повадкам.

Фамилия образована по стандартной русской модели: прозвище Крачок + притяжательный суффикс -ов, что буквально означает «сын Крачка» или «из семьи Крачка». Фамилия Крачков встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине, что подтверждает её диалектное происхождение. Встречается и вариант Крачковский — с польско-шляхетским суффиксом, но он значительно реже и может указывать на более позднее облагораживание фамилии или на географическое название.

Сословно Крачковы — почти наверняка крестьянская или мещанская фамилия. В дворянские родословные книги она не входила. Зато в XIX веке её носили несколько купеческих семей в Курской и Воронежской губерниях — там, где слово «крачка» или «крачок» было в ходу. Известных носителей мужской фамилии Крачков в истории немного, но в науке и культуре можно вспомнить разве что случайные совпадения — например, художника-графика с похожей фамилией Крачковский, но это уже другая ветвь.