Фамилия Крахотина восходит к прозвищу Крохотный — так обычно называли ребенка или человека маленького роста. В данном случае чередование гласных о/а является результатом «аканья». Маловероятной представляется этимологическая связь этой фамилии с существительным «крах», заимствованным во второй половине XIX в. из немецкого языка, где Krach имеет значение «банкротство; треск, шум». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Крохотный, со временем получил фамилию Крахотина.