Фамилия Крахоткины (в мужском роде — Крахоткин) — яркий образец славянской модели фамилий, образованных от прозвища или мирского имени. Её основа — «крахотка» или «крохотка» — в старых русских говорах означала «малютка», «крошка», «нечто очень маленькое». Скорее всего, прозвище Крахотка давали либо самому младшему ребёнку в семье, либо человеку невысокого роста. В некоторых диалектах слово «крахотный» значит «хрупкий», «мелкий», так что прозвище могло указывать и на телосложение.

Фамилия построена по самой распространённой в русском языке модели: к основе на -а добавили суффикс -ин (Крахотк-а → Крахотк-ин). Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Крахотки» или «из дома Крахотки». Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, а также для Беларуси. Встречаются варианты написания: Крахоткины, Крахоткин, реже — Крохоткин, что подтверждает связь с корнем «крох-» (малый).

С точки зрения социального контекста, Крахоткины — скорее всего, фамилия крестьянская или мещанская. Прозвища, связанные с внешностью или возрастом, давали в среде простых людей, и они легко закреплялись как фамилии после отмены крепостного права в 1861 году, когда крестьянам массово понадобились официальные родовые именования.

Хотя фамилия не принадлежит к числу древних аристократических родов, она ценна как документ народной культуры. Она сохранила забытое диалектное слово и показывает, как в языке отражался быт: маленького, «крахотного» человека в семье называли ласково, и это прозвище стало фамилией для его потомков. Точное место возникновения фамилии установить без архивных поисков сложно, но её основа прозрачна и не вызывает серьёзных споров среди ономатологов.