Фамилия Крахоткина — женская форма фамилии Крахоткин. В основе лежит прозвище или мирское имя Крахотка. Разберём эту основу, и сразу станет ясно, откуда пошла фамилия.

Слово «крахотка» в русских говорах (особенно южнорусских и украинских) означает «крошка», «маленький кусочек», «мелочь». В переносном смысле так могли назвать невысокого человека, ребёнка или того, кто был «мелковат» по положению, незначителен. Иногда прозвище давали младшему сыну в семье — как ласковое «кроха». Образовано это слово от общеславянского корня «крох-» (ср. «кроха», «крошить») с характерным для уменьшительных форм суффиксом «-отк-». То есть Крахотка — буквально «крошечка».

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Крахотк- добавлен патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Крахоткин, то есть сын, потомок Крахотки). Такая модель типична для фамилий, возникших из прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я.

С географической точки зрения фамилия Крахоткин (и Крахоткина) тяготеет к югу России и востоку Украины. Она встречается в Воронежской, Ростовской областях, в Краснодарском крае, а также в Белгородской области. Это объясняется тем, что слово «крахотка» активно бытовало именно в южнорусских диалектах. На севере и в центральной России чаще говорили «кроха» или «крошка», оттуда пошли фамилии Крохин, Крошкин.

Интересно, что в ряде случаев фамилия могла возникнуть не от прямого прозвища, а от местного названия мелкой монеты или меры веса — «крахотка» в некоторых говорах означала «полушка» (самая мелкая медная монета). Тогда родоначальник мог получить прозвище за прижимистость или за то, что торговал мелочью.

Таким образом, предки носительницы фамилии Крахоткина — скорее всего, крестьяне или посадские люди южнорусских земель, получившие прозвище по внешности или характеру: невысокий, щуплый, младший в семье или просто «мелкий» человек. Фамилия недворянская, простонародная, и в этом её историческая ценность — она прямо указывает на бытовую речь и уклад русской деревни.