Фамилия Крапотина — редкий случай, когда в основе лежит не профессия и не имя, а, скорее всего, иноязычное прозвище или диалектная особенность. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ин. Он указывает на принадлежность: Крапотина буквально значит «дочь (или жена) Крапоты». В русской ономастике фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ на -а/-я, и здесь основа Крапот- — это либо прозвище, либо искажённое личное имя.

Самая вероятная версия отталкивается от слова «крапот» (или «кропот») — в южнорусских и украинских говорах так называли мелкую работу, хлопоты, а также человека, который делает всё медленно, «кропотливо». В словаре Даля «кропот» — это хлопотун, копотун. Тогда Крапота — человек, который суетится, возится с мелочами, или наоборот — тот, кто делает всё тщательно, но медленно. Прозвище могло закрепиться за крестьянином-ремесленником, который, например, занимался поделочной работой дома.

Менее очевидная, но возможная версия — связь с греческим именем Крапот (или Кропот). В истории известен преподобный Кропот (Крапот) — святой, живший в Византии. Однако фамилии от канонических имён в России встречаются часто (Кропотов, например), и Крапотина могла возникнуть как вариант того же корня, но с другим суффиксальным оформлением. В этом случае предок мог носить имя Крапот в честь святого, а потом фамилия закрепилась через «потомка Крапота».

География фамилии неширокая. По данным переписей и телефонных справочников, Крапотины встречаются в основном в Центральной России и на юге — в Воронежской, Липецкой, Ростовской областях. Это совпадает с ареалом южнорусских говоров, где слово «кропот» было в ходу. Встречаются также варианты написания через «о» — Кропотина, но Крапотина — более редкая и, возможно, более старая форма, сохранившая «а» в корне.

Сословно фамилия не элитарная. В документах XIX века Крапотины — это государственные крестьяне и мещане, то есть свободные, но не дворяне. Никаких знаменитых носителей в истории не зафиксировано, что подтверждает её «низовое» происхождение.

Итог простой: фамилия образована от прозвища Крапота, которое дали человеку за его манеру работать — неспешно, с хлопотами. Это не громкая история, а бытовая, крестьянская — именно такие фамилии и составляют основу русского фамильного фонда.